O Instituto tem dois órgãos de governo e um órgão executor, os quais são regidos pelas disposições pertinentes da Convenção do IICA e por seus respectivos regulamentos. Além disso, dispõe de dois mecanismos especiais, criados pela Junta Interamericana de Agricultura (JIA): a Comissão Consultiva Especial de Assuntos Gerenciais (CCEAG) e o Comitê de Exame de Auditoria (CEA).
Órgão superior de governo do IICA, integrado pelos 34 Estados membros. Se reúne de forma ordinária a cada dois anos.
Órgão de governo constituído por 12 Estados membros, eleitos para exercícios de dois anos segundo critérios de rotação parcial e de equitativa distribuição geográfica. Celebra suas reuniões ordinárias anualmente.
Sede Central. 600 metros norte del Cruce Ipís Coronado Vázquez de Coronado, San Isidro 11101 – Costa Rica. San José, Costa Rica.
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